مستند خلیج کوچک داستان واقعی و شگفت‌انگیز گروهی از افراد نخبه، فیلم‌سازان و غواصان آزاد را روایت می‌کند که ماموریتی مخفیانه را برای نفوذ به یک خلیج پنهان در ژاپن آغاز می‌کنند تا پرده از رازی تاریک و مرگبار بردارند. اکتشافات تکان‌دهنده آن‌ها تنها مشتی نمونه خروار بود.

وقتی جیمز بالوگ، عکاس نشنال جئوگرافیک، این سوال را مطرح کرد که «چگونه می‌توان از تغییرات اقلیمی عکس گرفت؟» توجهش بلافاصله به سمت یخ‌ها جلب شد. طولی نکشید که از او خواسته شد تا یک گزارش ویژه برای جلد مجله درباره یخچال‌های طبیعی تهیه کند؛ گزارشی که به محبوب‌ترین و پرخواننده‌ترین مطلب این مجله در پنج سال گذشته تبدیل شد. اما برای بالوگ، آن گزارش تنها آغاز یک پروژه بسیار بزرگ‌تر و طولانی‌مدت بود که ابعادی حماسی به خود گرفت.

یک تیم غیرمنتظره از فعالان و نوآوران، مأموریتی جسورانه را برای نجات گونه‌های در حال انقراض آغاز می‌کنند.

دو سال پس از کشف «سو»، بزرگ‌ترین و کامل‌ترین اسکلت تیرانوسوروس رکس که تا به امروز یافت شده است، مقامات دولتی بقایای آن را توقیف کرده و مدعی می‌شوند که «سو» از زمین‌های فدرال دزدیده شده است.